腸道微生物群的建立與演化

新生仔豬的腸道最初由兼性厭氧菌如大腸桿菌（Escherichia，屬於變形菌門 Proteobacteria）與乳酸桿菌（Lactobacillus，屬於厚壁菌門 Firmicutes）進行定殖。

這些菌株消耗氧氣後，為專性厭氧菌如擬桿菌屬 Bacteroides、放線菌門 Actinobacteria與Firmicutes其他菌群提供無氧環境，使其逐步定殖。

在所有年齡的仔豬中，Firmicutes與Bacteroidetes始終為主導菌門；Fusobacteria與Proteobacteria則在哺乳期相對豐富，但會在離乳後逐漸減少。 Prevotella屬（可分解植物纖維）在離乳後的3個月內仍為主導菌群之一。

無菌仔豬的研究顯示，缺乏微生物會嚴重影響：

• 腸道屏障功能的發展
• 黏膜免疫系統的成熟與反應能力
  例如：無菌豬小腸中的上皮T細胞數量，僅為常規豬的三分之一。

腸道菌叢的早期變動，如來自母體、環境或飼料的菌源暴露、甚至早期抗生素使用，都會深遠影響免疫發育。

腸道上皮屏障的建立與變化

腸上皮屏障與腸道微生物群在出生後共同發展。腸道作為第一道屏障，負責養分吸收與病原防禦。初期食物與細菌抗原的通過，有助於教育腸道免疫系統，促進免疫耐受性（Menard et al., 2010）。實驗證明，完整蛋白質（相較於單純胺基酸混合物）對免疫系統成熟更具關鍵影響（Menezes et al., 2003）。

新生仔豬腸道吸收特性：初乳攝取後24小時內，大量蛋白質能通過腸道黏膜被吸收入血接著進入「腸道關閉（closure）」階段，免疫球蛋白等大分子不再通過（Westrom et al., 1984）3～4週齡仍可有限吸收小分子（如分子量766–1338 Da的PEG模型物質），但速率僅為出生時的十分之一。此外，少量細菌穿透腸黏膜，有助於腸道相關淋巴組織（GALT）的發展與免疫耐受建立。

離乳後的改變可分為兩階段：

若腸道通透性長期上升 → 抗原、毒素、病原穿透 → 誘發免疫反應 → 減少飼料攝取與日增重，同時提升營養需求以供應免疫反應（Solano-Aguilar et al., 2001）